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胡扯!---新冠状病毒中还有4个艾滋病毒片段?

时间:2020-02-02 阅读:3042

 胡扯!---新冠状病毒中还有4个艾滋病毒片段?

印度科研人员于2020年1月30日发表题为 “Uncanny similarity of unique inserts in the 2019-nCoV spike protein to HIV-1 gp120 and Gag” 文章,可翻译为“2019-nCoV刺突蛋白中独特片段与HIV-1 gp120和Gag的难以解释的相似性”,在biodix预印版上发表,没有经过同行评审,是十分粗糙的结果,胡扯题目和结论。现在变成国内阴谋论的理论基础,很多生物背景的博士也有转发了相关信息。其实有点生物信息学基础的研究人员都可以发现其结果的十分不靠谱,只是一个印度闹剧。

            HIV图示(来自互联网)

以下是简单几点分析下印度科研人员的离谱的“神”操作。

1) 文章中图1没有什么新意,不作介绍。先看图2(下图),说2019-nCoV的刺突蛋白有四个特异的插入,而他们只是把序列比对SARS,冠状病毒是一个大家族,除非所有冠状病毒没有片段,才可以勉强叫insert了,应该叫insertion/deletion(InDels)。谁知道是2019-nCoV插入还是SARS演化中缺失?

                 图 2(文章供图)

2)Insert2Insert3就更不是什么insert了。他们的结果算诚实,但流氓的把这个给放到了附件里Fig.S2(图3),可以看到蝙蝠Bat-SARS里的SARS就有,这是自然宿主来的,一模一样啊!!!这是自然中就有,那个有什么“Uncanny similarity”,还有什么狗屁不通的特异?                   

                           3(文章供图)

3)再看表1,这是似乎有点让大家担心,其实印度人就是牵强附会的想要这个数据和HIV联系起来。Insert1太短了,TNGTKR—6个氨基酸,拿到NCBI数据一比,有103个短肽和这个100%相同(图4,图5)。比如和U3小核RNA相关蛋白(U3 small nucleolar RNA-associated protein , XP_011272674.1) 100%相似这是在酵母中的,这种肽段应该是丰度很高的,且很多物种都有,这下你不怕了吧?如果这样讲是没意思,那么印度人就讲HIV(艾滋),吓吓中国人!!!

                                  表1(文章供表)



                                    图 4

                                   图 5

我们再来看Insert2-HKNNKS,根本就不是2019-nCov的特异片段,没有任何意义去深入分析。简单比下,也是上百个蛋白含有这个多肽,但又选择HIV再来吓你。同样,在Insert3-RSYLTPGDSSSG中,也根本就不是2019-nCov的特异片段,和HIV里的相似性差太多了,认真看看S-T, FNE的InDels, P-R,D-N;Insert3中,12个氨基酸中就有5个差异,会有什么功能的相似啊,“猪鼻子插葱装相”。 另外,Insert4- QTNSPRRA,比对下,这里面没有保守功能域,和100个蛋白序列都100%同源的(图6),但请大家记住这里面没有HIV。8个氨基酸,11个氨基酸的gap,这是相似?你真神,要怎么凑都可以凑个相似了。


                                        图 6

4)文章中的图3(如下图7)有什么意义?没有啊,前面都是不靠谱的,后面还做干这伙人是自己“命题作文”,自己“玩”。再有这什么蛋白模型,让人感觉很高深的样子。这个图早在是17年前,我们读研究生克隆基因片段做分析的最后一步。你如果想玩的话,到https://swissmodel.expasy.org/ 里随便发个序列,留下你的电子邮箱,过几天就收到这个MODEL了。印度人根据自己的命题作文进行了解译。这离真正的科学证据很远很远,好歹也来些点突变,片段编辑之后的实验验证再讲吧?


                                图  7 (文章供图)

总之,这所谓的4个片段,其中2个百分之百是原来在冠状病毒就有了,另外第一个insert1和100多个蛋白部分区域都100%相似,第四个和HIV不相似,而比HIV更相似也有100多个。你如果有空,可以随便找个基因组去找HIV的插入短小的片段,肯定能成功,不成你来找我!